Dengan tangkapan konformasi kromosom?

Dengan tangkapan konformasi kromosom?
Dengan tangkapan konformasi kromosom?
Anonim

Kaedah berasaskan penangkapan konformasi kromosom (3C) mendedahkan organisasi kromosom dalam nukleus dengan menentukan kedekatan fizikal pasangan titik sepanjang kromatin. Mereka mengekalkan interaksi kromatin dengan memaut silang diikuti dengan pemecahan, pengikatan dan penjujukan kawasan yang berinteraksi.

Bagaimanakah penangkapan konformasi kromosom berfungsi?

Tangkapan konformasi kromosom pada cip (4C) menangkap interaksi antara satu lokus dan semua lokus genom yang lain. Ia melibatkan langkah pengikatan kedua, untuk mencipta serpihan DNA yang dikelilingi sendiri, yang digunakan untuk melakukan PCR songsang. … Pada satu susunan mikro, kira-kira sejuta interaksi boleh dianalisis.

Apakah tangkapan konformasi kromatin?

Chromatin Conformation Capture (3C) ialah teknik penting yang digunakan untuk mengkaji struktur kromatin, serta asas untuk beberapa teknik terbitan lain. … Protokol ini melibatkan penyambungan silang formaldehid pada sel diikuti dengan pengasingan kromatin dan pencernaan dengan enzim sekatan.

Bagaimanakah penjujukan Hi-C berfungsi?

Pendekatan Hi-C meluaskan 3C-Seq untuk memetakan hubungan kromatin seluruh genom, dan ia juga telah digunakan untuk mengkaji interaksi kromatin in situ. Dalam kaedah ini, kompleks DNA-protein dikaitkan silang dengan formaldehid. Sampel dipecahkan, dan DNA diekstrak, diikat dan dicerna dengan enzim sekatan.

Apakah itu teknik Hi-C?

Teknik Hi-C klasik melibatkan pencernaan sekatan bagi genom berkait silang formaldehid dengan enzim sekatan khusus urutan, diikuti dengan mengisi dan membaiki hujung tercerna dengan penggabungan nukleotida berkaitan biotin. Hujung yang dibaiki kemudian diikat semula.

Disyorkan: