Bila hendak menggunakan homologi?

Isi kandungan:

Bila hendak menggunakan homologi?
Bila hendak menggunakan homologi?
Anonim

Model homologi juga boleh digunakan untuk mengenal pasti perbezaan halus antara protein berkaitan yang belum semuanya diselesaikan secara struktur . Sebagai contoh, kaedah ini digunakan untuk mengenal pasti tapak pengikatan kation pada Na+/K+ ATPase dan untuk mencadangkan hipotesis tentang pertalian pengikatan ATPase yang berbeza.

Apakah model homologi digunakan?

Pemodelan homologi ialah salah satu kaedah ramalan struktur pengiraan yang digunakan untuk menentukan struktur 3D protein daripada jujukan asid amino. Ia dianggap sebagai kaedah ramalan struktur pengiraan yang paling tepat. Ia terdiri daripada berbilang langkah yang mudah dan mudah digunakan.

Apakah pemodelan homologi dan mengapa ia diperlukan?

Pemodelan homologi memperoleh struktur tiga dimensi protein sasaran berdasarkan persamaan antara templat dan jujukan sasaran dan teknik ini terbukti berkesan apabila ia datang untuk mengkaji protein membran yang sukar untuk dihablurkan seperti GPCR kerana ia memberikan tahap pemahaman yang lebih tinggi tentang …

Bagaimanakah anda melakukan model homologi?

terdapat beberapa langkah yang terlibat dalam pemodelan homologi

  1. pemilihan templat menggunakan jujukan sasaran anda. Untuk tujuan ini, anda boleh melakukan carian BLASTp terhadap semua struktur protein yang tersedia (PDB). …
  2. Penjajaran templat dan jujukan sasaran. …
  3. Kualiti model anda. …
  4. Pemurnianmodel anda dengan sewajarnya.

Apakah yang menjadikan Pemodelan homologi yang baik?

Jika kita mentakrifkan "model homologi yang sangat berjaya" sebagai model yang mempunyai <=2 Å rmsd daripada struktur empirikal, maka templat mesti mempunyai >=60% identiti jujukan dengan sasaran untuk kejayaan kadar >70%. Walaupun pada identiti jujukan tinggi (60%-95%), sebanyak satu daripada sepuluh model homologi mempunyai rmsd >5 Å lwn.

Disyorkan:

Artikel yang menarik
Adakah pecahan saham Alibaba?
Baca lebih lanjut

Adakah pecahan saham Alibaba?

Alibaba Group (BABA) telah, setakat ini, tidak membahagikan sahamnya. Memandangkan harga sahamnya tidak begitu rendah, syarikat mungkin mempertimbangkan untuk membahagikan saham BABAnya pada masa hadapan. Berapa kali Baba telah berpisah?

Bilakah jahitan berganda bermula?
Baca lebih lanjut

Bilakah jahitan berganda bermula?

Antara akhir 80an dan awal 90an, kawasan tersebut dijahit dua kali untuk ketahanan yang lebih baik. Hanya pada tahun 2000-an pengeluar menambah jahitan di bahagian tepi badan; jika anda melihatnya, itu bukan pakaian vintaj tulen. Bilakah t-shirt menjadi dua jahitan?

Siapakah pemerintah Kreta yang pertama?
Baca lebih lanjut

Siapakah pemerintah Kreta yang pertama?

Minos, pemerintah legenda Crete; dia adalah anak kepada Zeus, raja para dewa, dan Europa, seorang puteri Phoenicia dan personifikasi benua Eropah. Adakah Raja Minos sebenar? Dulu masa dahulu, ketika Tamadun Minoan kuno berkembang di pulau Kreta, hiduplah seorang raja besar yang dikenali sebagai Minos.