Proline selalunya ditemui pada hujung α heliks atau secara bergilir-gilir atau gelung. Tidak seperti asid amino lain yang wujud hampir secara eksklusif dalam transformasi dalam polipeptida, prolin boleh wujud dalam konfigurasi cis dalam peptida.
Adakah heliks alfa mengandungi sisa prolin?
Sekarang terdapat lebih 30, 000 struktur protein dalam Bank Data Protein, adalah jelas bahawa sisa prolin terdapat dalam α-helices, di mana ia sering memainkan peranan penting dalam struktur dan fungsi protein.
Apakah asid amino yang terdapat dalam heliks alfa?
Mana-mana daripada 20 asid amino boleh mengambil bahagian dalam α-helix tetapi ada yang lebih disukai daripada yang lain. Ala, Glu, Leu dan Met paling kerap ditemui dalam heliks manakala Gly, Tyr, Ser dan Pro kurang berkemungkinan dilihat.
Adakah helaian beta mengandungi prolin?
Proline tidak diutamakan dalam struktur helaian beta kerana ia tidak dapat melengkapkan rangkaian ikatan-H. Apabila prolin berlaku dalam helaian, ia mungkin berada dalam bonjolan atau tepi kepingan di mana kekurangan penderma ikatan hidrogen amino tidak kritikal.
Apakah yang mengandungi heliks alfa?
Heliks alfa (α-helix) ialah motif biasa dalam struktur sekunder protein dan merupakan konformasi heliks tangan kanan di mana setiap tulang belakang kumpulan N−H hidrogen ikatan pada tulang belakang C=O. kumpulan asid amino yang terletak empat residu lebih awal di sepanjang jujukan protein.