Memandangkan sonication berpotensi merendahkan protein dan denatur epitop protein, kami seterusnya menilai kesan sonication pada integriti protein.
Bolehkah sonication merosakkan protein?
Jawapan Popular (1)
Protokol sonikasi standard agak tidak boleh menyebabkan pemecahan protein- tenaga terlalu rendah. Ia tidak sepatutnya menyebabkan denaturasinya. Ia boleh didenaturasi apabila anda menyonikannya terlalu lama dan terlalu panas sampel. Jika anda menggunakan kromatografi nikel jalur lain mungkin hanya kekotoran.
Bolehkah sonication memecahkan ikatan peptida?
Sonication biasanya tidak boleh memecahkan struktur utama proteinkerana struktur tersebut (jujukan asid amino) terbina daripada ikatan kovalen yang berkali ganda lebih kuat daripada ikatan Hidrogen dan sonikasi boleh menyediakan tenaga yang diperlukan untuk memutuskan ikatan tersebut.
Adakah sonikasi memecahkan membran nuklear?
A sonikasi pendek dengan tenaga rendah boleh mengganggu membran plasma tanpa memecahkan terlalu banyak membran mitokondria atau nuklear yang menghasilkan mitokondria taktik.
Adakah sonikasi diperlukan untuk pengekstrakan protein?
Pelarutan detergen (cth., SDS) yang diperlukan untuk pengasingan protein membran menghasilkan gam seperti lisat terutamanya kerana asid nukleik. Oleh itu sonikasi diperlukan dalam kes sedemikian untuk mengganggu asid nukleik ini. Sonication menjana banyak haba dan tidak baik untukbanyak protein.